PISSARO

Responsable Scientifique: Pascal Cosette Responsable Technique: David Vaudry Responsables Qualité (RMQ): Laurent Coquet, Clémence Châtelain

Contact

PISSARO
Centre universitaire de recherche et d’innovation en biologie (CURIB)
25 rue Tesnière
76821 Mont-Saint-Aignan
Phone: +33 235 14 6397
pascal.cosette@univ-rouen.fr

Adresse du site internet : http://plateforme-proteomique.crihan.fr

Créée en 2003, la plateforme PISSARO offre à la communauté scientifique, académique et industrielle, une expertise et des moyens technologiques efficaces et reconnus dans le domaine de la séparation, de l’identification et de la quantification des protéines et peptides, ainsi que dans l’étude de leurs modifications post-traductionnelles.

La plateforme est dotée d’un parc instrumental regroupant de nombreuses techniques: la spectrométrie de masse, la chromatographie liquide, le séquençage N-terminal, l’électrophorèse mono et bidimensionnelle... Un personnel dédié assure la maîtrise des appareillages, ainsi que la préparation des échantillons dans tous les domaines du vivant. Ce savoir-faire est mis à profit pour mener à bien ou contribuer à des projets de recherche sur des organismes variés: bactéries, Homme et plantes.

Moyens et équipements

Spectrométrie de masse et chromatographie :

• Couplage EASY-nLC et LTQ-Orbitrap Elite (Thermo Scientific),
• Couplage Ultimate 3000 et Q-Exactive (Thermo Scientific), 
• Couplage nano-LC, Chip et QTOF XT (Agilent),
• Couplage électrophorèse capillaire et QTOF 6520 (Agilent),
• Couplage UPLC 1290 et QQQ 6490 avec technologie iFunnel (Agilent),
• Spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF UltrafleXtreme (Bruker).

• Séquenceur Procise 494 (Applied Biosystems),
• Séquenceur Procise 492 (Applied Biosystems).

• Systèmes pour la focalisation isoélectrique : IPGPhor (GE Healthcare), Multiphore II (Pharmacia), IEFCell (BioRad) et offGel (Agilent),
• Systèmes pour le SDS-PAGE: PROTEAN II XL (BioRad) et Dodeca Cell Criterion (BioRad),
• Imageur biomoléculaire Typhoon FLA 9500 (GE Healthcare).

• Automate Multiprobe II (Perkin Elmer),
• Automate Biomek3000 (Beckman),
• Automate JANUS (Perkin Elmer).

• Identification des protéines : Mascot (Matrix Sciences), Proteome Discoverer (Thermo Scientific) et Spectrum Mill (Agilent),
• Séquençage de novo : Peaks Studio (Bioinformatics Solutions),
• Quantification : Progenesis QI (Waters), SameSpots (TotalLab) et Mass Profiler (Agilent),
• Annotation fonctionnelle: IPA (Qiagen).

Expertises et services

• Recherche translationnelle et identification de biomarqueurs à des fins diagnostiques, pronostiques, théranostiques, en particulier dans le contexte des maladies auto-immunes,
• Caractérisation de glycoprotéines, notamment de protéines thérapeutiques glycosylées,
• Recherche de cibles protéiques impliquées dans l'adhésion et la résistance bactérienne,
• Développement d’une expertise dans le domaine des modifications post-traductionnelles,
• Recherche et quantificat

• Lopez AG, Duparc C, Wils J, Naccache A, Castanet M, Lefebvre H and Louiset E. Steroidogenic cell microenvironment and adrenal function in physiological and pathophysiological conditions. Mol Cell Endocrinol 2021, 535: 111377.
  34216641
• Nicola C, Dubois M, Campart C, Al Sagheer T, Desrues L, Schapman D, Galas L, Lange M, Joly F and Castel H. The Prostate Cancer Therapy Enzalutamide Compared with Abiraterone Acetate/Prednisone Impacts Motivation for Exploration, Spatial Learning and Alters Dopaminergic Transmission in Aged Castrated Mice. Cancers (Basel) 2021, 13: 3518.
  34298734

• Corbière A, Walet-Balieu ML, Chan P, Basille-Dugay M, Hardouin J and Vaudry D. A Peptidomic Approach to Characterize Peptides Involved in Cerebellar Cortex Development Leads to the Identification of the Neurotrophic Effects of Nociceptin. Mol Cell Proteomics 2018, 17: 1737-1749.
  29895708
• Nobis S, Goichon A, Achamrah N, Guérin C, Azhar S, Chan P, Morin A, Bôle-Feysot C, do Rego JC, Vaudry D, Déchelotte P, , Belmonte L, and Coëffier M,. Alterations of proteome, mitochondrial dynamic and autophagy in the hypothalamus during activity-based anorexia. Sci Rep 2018, 8: 7233.
  29740148
• Péden R, Rocher B, Chan P, Vaudry D, Poret A, Olivier S, Le Foll F and Bultelle F. Highly polluted life history and acute heat stress, a hazardous mix for blue mussels. Mar Pollut Bull 2018, 135: 594-606.
  30301078

• Cases O, Obry A, Ben-Yacoub S, Augustin S, Joseph A, Toutirais G, Simonutti M, Christ A, Cosette P and Kozyraki R. Impaired vitreous composition and retinal pigment epithelium function in the FoxG1::LRP2 myopic mice. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 2017, 1863: 1242-1254.
  28366874
• Porte B, Hardouin J, Zerdoumi Y, Derambure C, Hauchecorne M, Dupre N, Obry A, Lequerre T, Bekri S, Gonzalez B, Flaman JM, Marret S, Cosette P and Leroux P. Major remodeling of brain microvessels during neonatal period in the mouse: A proteomic and transcriptomic study. J Cereb Blood Flow Metab 2017, 37: 495-513.
  26873886

• Arfi Y, Minder L, Di Primo C, Le Roy A, Ebel C, Coquet L, Claverol S, Vashee S, Jores J, Blanchard A and Sirand-Pugnet P. MIB-MIP is a mycoplasma system that captures and cleaves immunoglobulin G. Proc Natl Acad Sci U S A 2016, 113: 5406-11.
  27114507
• Breton J, Tennoune N, Lucas N, Francois M, Legrand R, Jacquemot J, Goichon A, Guérin C, Peltier J, Pestel-Caron M, Chan P, Vaudry D, do Rego JC, Liénard F, Pénicaud L, Fioramonti X, Ebenezer IS, Höfelt T, Déchelotte P and Fetissov SO. Gut Commensal E. coli Proteins Activate Host Satiety Pathways following Nutrient-Induced Bacterial Growth. Cell Metab 2016, 23: 324-34.
  26621107