PRIMACEN

Responsable Scientifique: David Vaudry Responsable Technique: Ludovic Galas Responsable Qualité (RMQ): Ludovic Galas, Magalie Bénard

Contact

PRIMACEN Université de Rouen Normandie, UFR Sciences et Techniques,
Centre Universitaire de Recherche et d’Innovation en Biologie (CURIB)

25, rue Lucien Tesnière
76821 Mont-Saint-Aignan cedex

Tél: 02-35-14-70-48

contact@primacen.fr

Adresse du site internet : http://primacen.fr

La plateforme PRIMACEN regroupe quatre services: synthèse peptidique et criblage fonctionnel, bio-imagerie photonique, microscopie électronique à transmission, microdissection et Q-PCR. Elle offre ainsi un continuum, depuis la synthèse de biomarqueurs et la préparation d’échantillons jusqu’à la localisation et la détermination de l’activité biologique de molécules d’intérêt.

PRIMACEN dispose d’équipements pour la synthèse, la purification et la caractérisation par spectrométrie de masse de peptides et d’analogues peptidiques. La plateforme propose également les équipements nécessaires à la préparation de cellules (culture) et de tissus (coupes, tranches, microdissection) d’origine variée (bactérienne, végétale, animale ou humaine), fixés ou vivants, et destinés notamment à l’imagerie. Un large spectre de résolutions multidimensionnelles est accessible grâce à la microscopie photonique, la macroscopie photonique et la microscopie électronique à transmission. PRIMACEN offre aussi la possibilité de déterminer l’activité biologique de molécules d’intérêt via des méthodes de criblage à moyen débit (bioessais) et la quantification de l'expression relative de gènes grâce à des analyses transcriptomiques (Q-PCR).

PRIMACEN s’investit par ailleurs dans le développement d'applications informatisées en support aux structures académiques et dans de nombreux domaines: communication, gestion de publications, livrables, patrimoines immobiliers, inventaires, congrès...

Moyens et équipements

Synthèse peptidique et criblage fonctionnel:

• 3 synthétiseurs de peptides,
• 4 HPLC,
• 2 spectromètres de masse MALDI-TOF,
• 2 lecteurs de plaques: Flexstation 3 et Victor V. 

• Microscope confocal inversé STED-FLIM avec laser blanc (Leica),
• Microscope confocal droit à platine fixe SP8 MP (Leica) avec laser pulsé infrarouge Chameleon (Coherent),
• Microscope confocal inversé gCW STED SP5 X avec laser blanc (Leica),
• Macroscope confocal et champ large LSI (Leica),
• Vidéomicroscopes : TIRF (Leica), Biostation (Nikon), Cell Discoverer 7 (Zeiss),
• Systèmes de microscopie à champ large, fond clair et sombre, à épifluorescence (Nikon),
• Système de microscopie Axioscope 7 (Zeiss),
• Macroscope champ large fond clair et fluorescence (illumination structurée) AxioZoom (Zeiss),
• Macroscope fond clair et fond sombre (Leica),
• Systèmes complets d’analyse d’images Imaris (Bitplane) et de déconvolution Huygens Professional (SVI),
• Laboratoire L2 culture cellulaire (cellules animales).

• Cryo-fixateur à haute pression HPM100 (Leica),
• Automate de cryo-substitution AFS2 (Leica),
• Ultramicrotome UC6 et cryo-ultramicrotome UC7 (Leica),
• Microscope électronique à transmission Tecnai 12 (FEI),
• Laboratoire L2 culture cellulaire (cellules végétales).

• 3 cryo-microtomes CM3050 et CM1950 (Leica), NX70 (Microm, Thermo Scientific),  
• 2 vibratomes VT1000 (Leica),
• 2 microdissecteurs (Leica, PALM Zeiss),
• 3 appareils de PCR quantitative (Q-PCR) et PCR digitale,
• 1 robot Bravo (Agilent).

Expertises et services

• Développement d’outils pharmacologiques, thérapeutiques et diagnostiques, 
• Etude de la signalisation, prolifération et apoptose cellulaire par bioessais,
• Imagerie de fluorescence à haute et super résolution spatiale et temporelle,
• Traitement et analyse d’images : déconvolution et modélisation multidimensionnelle,
• Microscopie électronique à transmission et cryo-méthodes,
• Microdissection laser couplée à l'analyse d’expression par PCR en temps réel à haut débit,
• Développement d’applications informatisées.

• El Mehdi M, Takhlidjt S, Devère M, Arabo A, Le Solliec MA, Maucotel J, Bénani A, Nedelec E, Duparc C, Lefranc B, Leprince J, Anouar Y, Prévost G, Chartrel N and Picot M. The 26RFa (QRFP)/GPR103 neuropeptidergic system in mice relays insulin signalling into the brain to regulate glucose homeostasis. Diabetologia 2022, 65(7): 1198-1211.
  35476025
• Faklaris O, Bancel-Vallée L, Dauphin A, Monterroso B, Frère P, Geny D, Manoliu T, de Rossi S, Cordelières FP, Schapman D, Nitschke R, Cau J and Guilbert T. Quality assessment in light microscopy for routine use through simple tools and robust metrics. J Cell Biol 2022, 221(11): e202107093.
  36173380
• Heron C, Dumesnil A, Houssari M, Renet S, Lemarcis T, Lebon A, Godefroy D, Schapman D, Henri O, Riou G, Nicol L, Henry JP, Valet M, Pieronne-Deperrois M, Ouvrard-Pascaud A, Hägerling R, Chiavelli H, Michel JB, Mulder P, Fraineau S, Richard V, Tardif V and Brakenhielm E. Regulation and impact of cardiac lymphangiogenesis in pressure-overload-induced heart failure. Cardiovasc Res 2022, 086
  35689481
• Leroux S, Rodriguez-Duboc A, Arabo A, Basille-Dugay M, Vaudry D and Burel D. Intermittent hypoxia in a mouse model of apnea of prematurity leads to a retardation of cerebellar development and long-term functional deficits. Cell Biosci 2022, 12(1): 148.
  36068642
• Ropitaux M, Hays Q, Baron A, Fourmois L, Boulogne I, Vauzeilles B, Lerouge P, Mollet JC and Lehner A. Dynamic imaging of cell wall polysaccharides by metabolic click-mediated labeling of pectins in living elongating cells. Plant J 2022, 110(3): 916-924.
  35165972

• Bénard M, Schapman D, Chamot C, Dubois F, Levallet G, Komuro H and Galas L. Optimization of Advanced Live-Cell Imaging through Red/Near-Infrared Dye Labeling and Fluorescence Lifetime-Based Strategies. Int J Mol Sci 2021, 22: 11092.
  34681761
• Galas L, Burel C, Schapman D, Ropitaux M, Bernard S, Bénard M and Bardor M. Comparative Structural and Functional Analyses of the Fusiform, Oval, and Triradiate Morphotypes of Phaeodactylum tricornutum Pt3 Strain. Front Plant Sci 2021, 12: 638181.
  33912207
• Komuro Y, Galas L, Morozov YM, Fahrion JK, Raoult E, Lebon A, Tilot AK, Kikuchi S, Ohno N, Vaudry D, Rakic P and Komuro H. The Role of Galanin in Cerebellar Granule Cell Migration in the Early Postnatal Mouse during Normal Development and after Injury. J Neurosci 2021, 41: 8725-8741.
  34462307
• Le H, Arnoult C, Dé E, Schapman D, Galas L, Le Cerf D and Karakasyan C. Antibody-Conjugated Nanocarriers for Targeted Antibiotic Delivery: Application in the Treatment of Bacterial Biofilms. Biomacromolecules 2021, 22: 1639-1653.
  33709706
• Lopez AG, Duparc C, Wils J, Naccache A, Castanet M, Lefebvre H and Louiset E. Steroidogenic cell microenvironment and adrenal function in physiological and pathophysiological conditions. Mol Cell Endocrinol 2021, 535: 111377.
  34216641

• Carmon O, Laguerre F, Riachy L, Delestre-Delacour C, Wang Q, Tanguy E, Jeandel L, Cartier D, Thahouly T, Haeberlé AM, Fouillen L, Rezazgui O, Schapman D, Haefelé A, Goumon Y, Galas L, Renard PY, Alexandre S, Vitale N, Anouar Y and Montero-Hadjadje M. Chromogranin A preferential interaction with Golgi phosphatidic acid induces membrane deformation and contributes to secretory granule biogenesis. FASEB J 2020, 34: 6769-6790.
  32227388
• Chalfouh C, Guillou C, Hardouin J, Delarue Q, Li X, Duclos C, Schapman D, Marie JP, Cosette P and Guérout N. The Regenerative Effect of Trans-spinal Magnetic Stimulation After Spinal Cord Injury: Mechanisms and Pathways Underlying the Effect. Neurotherapeutics 2020
  32856173
• Delarue Q, Mayeur A, Chalfouh C, Honoré A, Duclos C, Giovanni MD, Li X, Salaun M, Dampierre J, Vaudry D, Marie JP and Guérout N. Inhibition of ADAMTS-4 Expression in Olfactory Ensheathing Cells Enhances Recovery after Transplantation within Spinal Cord Injury. J Neurotrauma 2020
  31264504
• Houssari M, Dumesnil A, Tardif V, Kivelä R, Pizzinat N, Boukhalfa I, Godefroy D, Schapman D, Hemanthakumar KA, Bizou M, Henry JP, Renet S, Riou G, Rondeaux J, Anouar Y, Adriouch S, Fraineau S, Alitalo K, Richard V, Mulder P and Brakenhielm E. Lymphatic and Immune Cell Cross-Talk Regulates Cardiac Recovery After Experimental Myocardial Infarction. Arterioscler Thromb Vasc Biol 2020
  32404007
• Wils J, Duparc C, Cailleux AF, Lopez AG, Guiheneuf C, Boutelet I, Boyer HG, Dubessy C, Cherifi S, Cauliez B, Gobet F, Defortescu G, Mé, nard JF, Louiset E, Lefebvre H and . The neuropeptide substance P regulates aldosterone secretion in human adrenals. Nat Commun 2020, 11: 2673.
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• Arkoun B, Galas L, Dumont L, Rives A, Saulnier J, Delessard M, Rondanino C and Rives N. Vitamin E but Not GSH Decreases Reactive Oxygen Species Accumulation and Enhances Sperm Production during In Vitro Maturation of Frozen-Thawed Prepubertal Mouse Testicular Tissue. Int J Mol Sci 2019, 20:  E5380.
  31671759
• Léger C, Dupré N, Aligny C, Bénard M, Lebon A, Henry V, Hauchecorne M, Galas L, Frebourg T, Leroux P, Vivien D, Lecointre M, Marret S and Gonzalez BJ. Glutamate controls vessel-associated migration of GABA interneurons from the pial migratory route via NMDA receptors and endothelial protease activation. Cell Mol Life Sci 2019
  31392351

• Alim K, Lefranc B, Sopkova-de Oliveira Santos J, Dubessy C, Picot M, Boutin JA, Vaudry H, Chartrel N, Vaudry D, Chuquet J and Leprince J. Design, Synthesis, Molecular Dynamics Simulation, and Functional Evaluation of a Novel Series of 26RFa Peptide Analogues Containing a Mono- or Polyalkyl Guanidino Arginine Derivative. J Med Chem 2018, 61: 10185-10197.
  30358997
• El Amki M, Dubois M, Lefevre-Scelles A, Magne N, Roussel M, Clavier T, Guichet PO, Gérardin E, Compère V, and Castel H,. Long-Lasting Cerebral Vasospasm, Microthrombosis, Apoptosis and Paravascular Alterations Associated with Neurological Deficits in a Mouse Model of Subarachnoid Hemorrhage. Mol Neurobiol 2018, 55: 2763-2779.
  28455691

• Benjdia A, Guillot A, Ruffié P, Leprince J and Berteau O. Post-translational modification of ribosomally synthesized peptides by a radical SAM epimerase in Bacillus subtilis. Nature Chem 2017, 9: 698-707.
  28644475
• Schapman D, Perraudeau C, Bénard M, Gallavardin T, Boulangé A, Leleu S, Lebon A, Franck X, Galas L. Characterization of fluorescent synthetic epicocconone-based dyethrough advanced light microscopies for live cell imaging applications. DYES PIGMENTS 2017, 141: 394-405.